Francisco Pizarro fut un des plus fameux conquistadors venus d'Espagne pour le compte de laquelle il parvint à soumettre et conquérir le Pérou des Incas. Fils naturel, analphabète, du navigateur Gonzalo Pizarro, il s'engagea dans l'armée, avec son père, et fit la campagne d'Italie puis gagna l'Amérique avec Nicolas de Ovando en 1502. Nommé lieutenant de Alonso de Ojeda à San Sebastian de Uraba en 1510, il accompagnait Balboa dans l'expédition qui découvrit l'océan Pacifique en 1513.

En 1524, après différents voyages à travers les océans, Pizarro l'ecclésiastique s'est associé avec Diego de Almagro et Hernando de Luque pour découvrir l'Empire des Incas (le Tahuantinsuyo). Trois voyages ont été nécessaires avant d'obtenir la conquête définitive du continent.

Le premier voyage effectué en 1524, a eu comme point de départ Panama, et prenaient part à l'entreprise 112 hommes. Pizarro partit d'abord et a été suivi par Almagro avec 80 hommes. Mais l'aventure s'est soldée en échec.

Pizarro entama une seconde expédition avortée entre 1526 et 1528. Ensuite, la côte équatorienne a été explorée et Pizarro est arrivé à Tumbes (ville du nord du Pérou), ville qui confirmait l'existence du royaume qu'il cherchait.

L'étape suivante de Pizarro sera de faire un voyage vers l'Espagne pour informer l'empereur Carlos des richesses de Tumbes. A Tolède il connut Hernán Cortes et obtint la signature de la Capitulation de Tolède (26/07/1529) par laquelle on accordait à Francisco Pizarro la charge de Capitaine Général et Gouverneur de la Nouvelle Castille, nom accordé aux terres péruviennes, ainsi qu'une pension de 1 000 duchés. Il fait les voyages avec les trois célèbres caravelles : Santa María, La Niña y la Pinta.

Le troisième voyage commença au début de l'année 1531. En arrivant à Tumbes Pizarro a constaté à quel point la ville avait été marquée par la guerre civile entre Huascar et Atahualpa, entamée à la mort de leur père, Huayna Capac. Francisco Pizarro pénétra dans le pays Inca en maintenant ses troupes à pied et à cheval dans les alentours du littoral. Ils prirent la direction du cœur de l'Empire : les Andes. Malgré les difficultés, le 15 novembre de 1532 les espagnols atteignirent Cajamarca, à l'époque ville abandonnée.

Pizarro envoya un ambassadeur à la rencontre d'Atahualpa, récent vainqueur de son rival Huascar, qui lui fit part de la présence hispanique dans l'Empire et son désir de se réunir avec lui. Atahualpa arriva accompagné de 10 000 hommes de Quito désarmés ce qui facilita sa capture. L'Inca a offert aux Espagnols une grande quantité de richesses en échange de la liberté mais qui n'empêchera pas son exécution en juillet 1533.

En août de la même année, Pizarro accompagné des faibles troupes espagnoles et des collaborateurs quechuas arrive à Cusco, capitale de l'Empire Inca. Il prit la ville et se transformait en propriétaire du Pérou, bien que reconnaissant comme Inca Manco Cayac.

Le 18 janvier 1535, Pizarro fonde la nouvelle capitale : Lima, la Ville des Rois. Almagro est nommé gouverneur de la Nouvelle Tolède et Pizarro le persuada d'entreprendre une expédition pour la conquête du Chili (1535-1536).

Entre Pizarro et Almagro, la propriété de l'opulente ville de Cuzco fut un sujet de discorde, et le motif des premières escarmouches entre pizarristes et almagristes. Cependant les abus des frères de Pizarro allumèrent une révolte des Indiens, menée par Manco Inca en 1536 à travers tout le pays. Lima et Cuzco furent assiégées, mais l'armée indienne, par manque de préparation, dut se replier.

De retour déçu de son expédition au Chili en 1537, Almagro, entra en triomphe à Cuzco et fit prisonnier Hernando. Pizarro, repoussa l'assaut des Indiens à Lima, obtint la remise en liberté de son frère, et réclama la souveraineté sur Cuzco. En avril 1538, Hernando vainquit Almagro à la bataille de Las Salinas (avril 1538), le fit prisonnier et l'exécuta immédiatement.

Cependant, Manco Inca continuait la résistance face aux Espagnols, et les almagristes, groupés autour de Diego el Monzo Almagro (fils de Diego de Almagro), attisaient les mécontentements contre Pizarro. Vaca de Castro fut envoyé par la Couronne pour mettre fin à cette dispute, mais les almagristes précipitèrent la conspiration contre Pizarro, et le 26 juin 1541, donnèrent l'assaut au palais, mirent Pizarro à mort et proclamèrent Almagro le Jeune comme nouveau gouverneur. Finalement il fut lui-même arrêté et décapité par Vaca de Castro qui prit la succession de Francisco Pizarro.